On sait depuis longtemps que les populations de botrytis sont très diverses. C'est l'une des raisons pour lesquelles cette maladie s'accommode assez rapidement des fongicides. La nature de cette diversité est plus profonde qu'on ne l'imaginait. Selon l'Inra de Versailles, il existerait au moins deux espèces différentes de botrytis infectant les vignes en Champagne. L'Institut les a dénommées Botrytis vacuma et Botrytis transposa. La première est moins bien adaptée à la vigne que la seconde. Botrytis transposa se retrouve en majorité sur les baies. Elle est plus homogène et stable que sa cousine. L'Inra poursuit son travail dans le vignoble bordelais afin de voir si là aussi, il existe plusieurs espèces.