Dominique Bussereau accorde beaucoup d'importance à la création des comités de bassin. Fin décembre, il a écrit aux préfets de région, afin qu'ils réunissent rapidement les responsables professionnels, et qu'ils nomment un coordinateur chargé de faire avancer les dossiers. Le 6 janvier, les premières réunions avaient lieu en Languedoc-Roussillon et dans le Val de Loire.
Le ministre de l'Agriculture veut que les comités soient opérationnels au début du mois de mars.